利用GEO数据库分析子宫内膜异位症潜在致病基因
1.北京协和医学院研究生院；2.国家卫生健康委科学技术研究所
Analysis of candidate pathogenic genes of endometriosis using GEO Database
1.Graduate School of Peking Union Medical College, Beijing, 100730; 2.National Research Institute for Family Planning
摘要 目的：探究作用于月经增殖期及分泌期子宫内内膜异位症的共享潜在致病基因。方法：利用两个原始数据集GSE7305、GSE25628，筛选出18例子宫内膜异位症患者在位子宫内膜与匹配的异位子宫内膜组织相比的差异表达基因（DEGs），并使用基因本体论分析，KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)分析，利用STRING 11.0建立蛋白质相互作用网络。利用Cytoscape MCODE软件筛选热点模块并使用BiNGO进行相关基因的GO分析。 结果：两个数据集共享96个DEGs。基因本体论分析显示DEGs富集于补体激活等通路。CLU等基因可能介导补体激活参与子宫内膜异位症的发生发展。结论：CLU等基因可能通过参与补体激活参与子宫内膜异位症的发生发展。
关键词 ：
子宫内膜异位症 ,
致病基因 ,
生物信息学分析 ,
CLU基因 ,
GEO数据库
引用本文:
张思阳1,2潘虹1,2王彬彬1,2. 利用GEO数据库分析子宫内膜异位症潜在致病基因[J]. 中国计划生育学杂志, 2020, 28(4): 470-.
链接本文:
https://www.zgjhsyx.com/CN/ 或 https://www.zgjhsyx.com/CN/Y2020/V28/I4/470
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